2000. - danas
Kroz klub su u kratkoj povijesti prošli poznati igrači: I. Radoš, V. Vujeva, I. Vitko, B. Vulejlija, N. Vidiček, A. Kovačević, I. Milas, S. Bandalo, D. Kablar, S. Terihaj, R. Štrbac, A. Ištuk, S. Bašić, I. Kos, M. Sergo, R. Mustapic i V. Deak. Uz gore navedene trenere, u klubu su bili treneri i Božićević, Doberšek, Vegel, M. Vlahović, Dragozet, Bašić, Lujanac, Smiljanec, Murić, Miletić, Brlek, Lovrentjev, Katovčić i Čakanić.
Od klupskih dužnosnika najučinkovitiji je bio Božo Jurković, koji je do 2009. godine bio jedini koji je morao osigurati financijsku stabilnost i sve uvjete za funkcioniranje kluba. Svi uspjesi pokrenuti su njegovim dolaskom u klub, a danas je gotovo nezamislivo i neprocjenjivo sve dosad urađeno u klubu u tako kratkoj povijesti s njim na čelu, a tu su ga u organizacijskom i izvršnom dijelu slijedili još neki entuzijasti na čelu s "katicama za sve" tajnikom Mladenom Vlahovićem i blagajnikom Dragutinom Prešnjakom. Treba istaknuti i ostale koji se u kratkoj povijesti kluba pridonijeli da klub postane to što je danas, tu prije svih treba spomenuti:, J. Lastovčića, V., B. i I. Vlahovića, P. Mihalinca, B. Dobranića, V. Vrančića i J. Mustafića. B. Beljak, J. Buricu, Z. Kodrnju, I. Rukavinu.
U sezoni 1998/99. momčad je pomlađena, a sve se više pozornosti posvećuje pionirima i juniorima. S najmlađima radio Dragutin Prešnjak. Veliku ulogu omladinskog pogona odigrao je Damir Dragozet koji je u radu omladinske škole sudjelovao do 2008. godine te je višegodišnjim uspješnim i kontinuiranim radom stvorio nekoliko igrača koji dan danas igraju za seniorsku momčad.
Svakako najveći uspjeh u mlađim kategorijama je onaj iz ove 2001/2002 sezone kada su naši mlađi pioniri osvojili prvo mjesto u prvoj jedinstvenoj ligi pored klubova iz znatno višeg ranga i reputacije: NK Inker, NK Samobor, NK Radnik, NK Vrbovec i drugi. Uz to još su osvojili obje kategorije pionira u sezoni 1999/2000 prva mjesta u svojim ligama i kup NS Samobor.
Godine 2006. kadeti pod vodstvom D. Dragozeta ostvaruju vjerojatno najveći uspjeh Samoborskog nogometa kad su u pitanju mlađe uzrasne kategorije, osvajanjem kupa NSS-a i NSZŽ-a dolaze do finala kupa Središta te službene utakmice protiv NK Dinamo-Zagreb i ulaska u 10 najboljih kadetskih ekipa u Hrvatskoj.
Godine 1999. osnovana je i momčad veterana koja je redovno igrala u ligi NSS-a preko 10 godina, a ugašena je nakon što je preminuo čovjek koji ju je osnovao i vodio dugi niz godina - legendarni Božo Vlahović - Sina.
Nakon odlaska B. Jurkovića iz kluba, za predsjednika je izabran Ž. Radovanić koji je uz tajnika Mladena Vlahovića vodio klub do 2015. godine te je u tom periodu napravljen značajan pomak u organizaciji samog kluba.
2015. godine predsjednik je bio Juraj Milječki, a od 2016. godine Robert Kirin koji je na toj dužnosti bio do 2023. godine. Uz njega klub s pozicije direktora od 2014. godine vodi Mario Vlahović, a pomaže im i još nekoliko entuzijasta, u početku K. Belak i I. Koletić, a kasnije R. Horvat, B. Černauš, M. Radovanić, M. Vlahović, D. Prešnjak i ostali. Od 2016. do 2021. godine klub se organizacijski i financijski konsolidirao, a uz pomoć grada Samobora napravljeni su i veliki infrastrukturni zahvati: promjena krovišta i legalizacija objekta, rasvjeta kompletnog pomoćnog igrališta, natkrivanje tribine te svakako najveći projekt koji je započeo početkom 2021. godine - izgradnja terena s umjetnom travom.
od 2023. godine predsjednik kluba je Danijel Slak koji uz gore navedenu ekipu vodi klub u dobrom i sigurnom smjeru. Od 2024. godine voditelj škole nogometa postaje David Kižlin koji je pokrenuo značajan napredak u školi nogometa koja 2025. godine broji preko 150 aktivnih mladih nogometašica i nogometaša.